一，两者办学经费来源不同
1，公立学校办学经费来源政府财政支出，还有一部分来自企业方面的捐款。
2，民办初中在当地教育主管部门备案，在其审核通过后靠自筹办学经费，自购教育设施，自备教学场所，其办学经费来自企业与个人捐款。自主招生，自主招聘教师是民办私立学校的一大特色，民办初中性质属于社会力量办学范畴，是社会办学的一部分。
二，两者办学性质上的不同
1，公办初中是由国家和政府完全出资兴办的学校，完全属于政府行为。
2，民办初中是指国家机构以外的社会组织或者个人，利用非国家财政性经费，它的出现社会发展必要结果，弥补了政府财政支出上的不足和困难，是国家办学的有益之补充，与公办学校一样，受当地教育主管部门管辖。
三，两者收费上的不同
公办初中在义务教育阶段，只需要交学杂费，因此收费比较便宜。
民办初中：因为完全靠自筹经费办学，没有政府财政上补足，完全靠学生所交费用应付学校各项开支，因此收费较昂贵，当然在收费上也受当地教育主管部门监督和物价部门审核。有些地方民办贵族学校在收费上大大地超过家长接受范围和承受能力，也是阻挡这部分民办私立学校进一步发展的原因。
四、两者师资方面特点不同
公办初中：因为学校属于事业单位，故而师资比较稳定。
民办初中：大多数民办学校师资属于学校聘任，学校与老师之间双向选择，学校对教师选择性大，对于不合格与不称职的及时予以解聘，因而师资队伍不太稳定，教师流动比较大，但是保障了学校教师整体水平，有利于提高民办私立学校的教学质量，现在很多民办学校为了提高教学质量，扩大社会影响，提高学校的社会知名度，聘请了高学历，有丰富经验的教师来学任教，在保障了学校教学质量同时，努力提高教师待遇，稳定了教师队伍。
五、课程方面
公办初中：公办初中都是按照国家的统一教材上课。
民办初中：教学课程几乎与公办学校一样，为了突出自己的特色，吸引学生，学校可能相应地增加其他方面的特长教育，例如: 音乐，美术，体育等等。
六、升学方面
公办初中： 小学毕业生按照户口所在地直接对口升学，因为属于义务教育阶段，因而入学比较容易。当然他们也可以选择当地的民办私立初中入读。
民办初中：民办初中比较灵活，学生资源主要来自于以下四个方面，由于民办初中招生已经纳入当地教育局统筹范围
1，各地分片就近入学原则；2，部分农民工的子女；3，留守儿童；4，其他
七、住宿方面
公办初中：实现全部寄宿制度，部分就近学生可以走读。
民办初中：因为学校场地等各方面限制，多数民办初中可以走读或寄宿，我们这里全部实现全封闭的寄宿制，学生每个月才有一次回家的机会。
八，教学质量
1，可以说，在校学生的数量与学校教学质量是民办私立学校生存的生命线，由于社会上人们对民办私立学校认知上的存在的一定的偏见，造成有些民办学校学生生源数量得不到有效的保障，学校需要吸引学生数量和优质生源。现在很多民办初中教学质量要高于当地的公办学校，很多民办私立学校学风也好学于当的公办学校，这也是民办私立学校的优势所在，也是很多家长与学生选择对象。民办学校压力山大，因而在这很多面要付出比较多，近些年来民办私立办学成绩也逐渐地得到社会的认可，家长们与孩子们的认可，随着国家也加大对民办私立学校的支持力度，今后民办私立学校会越办越好。
2，民办学校教师相对而言比较努力，因为学生成绩好坏直接与教师工资与奖金挂钩，教师不努力就有随时被解聘的危险。
3，民办学校学生在校外补习情况比较少，因为是全封闭教学，学生吃喝拉撒全部在校内，每个月只能回去一次，民办私立学校一直是大多数留守学生的最好选择。
4，当地优秀的公办学校一直是家长们与孩子首选学校，毕竟它有政府财政和政策大力的支持，有庞大的优秀教师数量与先进的教学设施，以及良好的口碑，也是公办学校办学的一大优势所在。
九，综上，两者各有各的特点，家长可以根据本身实际情况选择，如果家长几乎没有时间照顾自己孩子，可以选择民办初中入学，因为他是全封闭的，安全与学习都有保障，同时也能培养孩子的独立能力与自律能力，在这一点上，公办学校完全没有办法办到的，这也是民办学校的优势所在，但是缺点是收费较贵；如果家长完全有能力照顾自己的孩子，那么可以考虑公办初中，毕竟它收费较少。所以没有最好的，只有最适合自己才是最好的学校。
